再有就是，秦清决定在废除卫所制度的同时裁撤名存实亡的五军都督府，收权于兵部，兵部又听令于
阁，阁集军政权于，直接听命于皇帝，最终的决定权还是在皇帝手中。
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总而言之，阁统领六部、都察院、地方督，阁成员由六部尚书或其重臣充任，阁拥有票拟之权，废黜宦官之，皇帝直接掌批之权，拥有最终决定之权。
这是官职的化，除此之外，秦清也可能地简勋官、散官、爵位。
魏素有职官、勋官、散官之分，职官就是真正掌实权的官职，比如六部九卿、地方督等等，散官又称散阶，没有职权，只是个名，享有对应品级的待遇。
勋官则是类似于爵位，又完全相同。比如名鼎鼎的“柱国”是正品的勋官，比如某些重臣故去时，皇帝赠“柱国”，是封赏勋官。
秦清决定废除勋官和散阶制度，只保留爵位制度。爵位自皇帝以，分为七等：王、郡王、公爵、侯爵、伯爵、子爵、男爵，论外，得世袭罔替，依次递减，直至庶。
同时秦清又保留了“三公”、“三孤”、“三师”、“三少”，也就是：太师、太傅、太保、少师、少傅、少保、太子太师、太子太傅、太子太保、太子少师、太子少傅、太子少保等十二个荣誉官职，并无实权，用以加封或追赠。
其中“三公”是为正品，“三孤”是为从品，“三师”是为正二品，“三少”是为从二品。
当年张肃卿就曾被加封太师，被视为位极臣。按照规矩，加封太师之，皇帝执子礼，所以很少有能生加封太师，多是被追赠。同理，储君对太子少师也执子礼。
当秦清将消息放之，朝议论纷纷，没有几敢奢“三公”，能够传给子孙代的爵位才是关键，如今还看赵政和秦襄的爵位如何，才能确定其的爵位。这两位个是文臣之首，个是武将之首，若能得王爵，其次等之也许能封公爵，可如果两仅仅是公爵，那么其就是候、伯爵位了。
至于秦远和秦方二，为宗室，能概论之，多半都是王爵，可就算如此，宗室也显得十分单薄。
如今秦方为地方督，并在帝京城中，秦远跟随秦清到帝京，除了担任户部尚书之外，还兼了宗令，只是如今宗室数稀少，也没有什么好管的，主就是会同礼部尚书梅盛林起将朝徐家诸帝迁太庙，再将秦家祖先迁入其中，算得什么难事，关键是繁琐。
秦清忙于政，秦襄的战事却是极为顺利。
在太平宗的协助，秦襄于七月底占了芦州全境，楚州成为孤地，各府县纷纷请降，几乎是战而。在此程中，沈元重、许飞等戴罪立功，秦襄奏朝廷之，任命沈元重为芦州巡，任命许飞为楚州布政使。
如此，形成了方隔江对峙的局面，失去芦州之，千里江防，皆是破绽，渡江并非难事。
另边，官莞、宁忆的和谈也十分顺利。
严格说，鹿先生、四位山主、宁奇、黄石元等都是门的俘虏，没有谈判的资格，而司玄没有参与最的帝京之战，才能够真正代表儒门与门谈判。
此次谈判，门允许儒门保留四书院，可三学宫却废黜两座，只能保留座，以此作为对儒门的惩戒。在屋檐得低头，司玄最终同意让万象学宫，废黜天心学宫，保留历史最为久远的社稷学宫。
如今天心学宫还在谢恒、杨松、邸姜夫、金蟾叟、赤羊翁等的手中，负隅顽抗，南魏小朝廷的背也少了们的支持，所以天心学宫是必然被废黜的。至于万象学宫，则是司玄风峻节了，虽然是万象学宫的祭酒，但考虑到社稷学宫曾亚圣和荀卿等先贤，历史最为悠久，而万象学宫的是明女帝修建的万象神宫，足以与社稷学宫相提并论，于是主保存社稷学宫。
和议之，司玄自称无颜面对历代先贤，主辞去祭酒之位，归隐山林。
李玄都得到消息之，边调集门天境以的手，准备铲除儒门最的抵抗，方面又令改万象学宫为万象宫，驱逐其中儒门子，改为祭祀太祖、南华君、杨朱等门先贤，同时李玄都念师李虚曾在此地学，又令在万象学宫增设师李虚的牌位，位于诸位先贤之。
此事由宁忆全权负责，陆时盈协助。
宁忆当年也曾是万象学宫的子，可如今却成了门之，反头改建万象学宫为万象宫，得说造化。李玄都此举并非故意使宁忆难堪，打算将未的万象宫发展成为类似于太学的学之地，召集各路名师在此传受业，定期请部分真、真在此讲学，凡门子，皆可此造，由宁忆任第任宫主。
陆时盈也就是陆夫，只是暂时协助，在成立门之，李玄都会仿照客栈的结构设六堂，其中专管财政者为度支堂，由陆时盈任首任堂主。
和谈之，在官莞的指挥，以阳宗、皂阁宗、真传宗为主的门，举入中州，秦中总督王檀承受住门的巨，在失去最的庇护，主请降。
秦清任命王檀为中州巡，任命李如是为秦中总督。
